Huyện Prachatice (tiếng Séc: Okres Prachatice) là một huyện (okres) nằm trong vùng Nam Bohemia của Cộng hòa Séc. Huyện Prachatice có diện tích 1375 km², dân số năm 2002 là 51.41 người. Thủ phủ huyện đóng ở Prachatice. Huyện này có 65 khu tự quản.
Babice - Bohumilice - Bohunice - Borová Lada - Bošice - Budkov - Buk - Bušanovice - Chlumany - Chroboly - Chvalovice - Čkyně - Drslavice - Dub - Dvory - Horní Vltavice - Hracholusky - Husinec - Kratušín - Křišťanov - Ktiš - Kubova Huť - Kvilda - Lažiště - Lčovice - Lenora - Lhenice - Lipovice - Lužice - Mahouš - Malovice - Mičovice - Nebahovy - Němčice - Netolice - Nicov - Nová Pec - Nové Hutě - Olšovice - Pěčnov - Prachatice - Radhostice - Stachy - Stožec - Strážný - Strunkovice nad Blanicí - Svatá Maří - Šumavské Hoštice - Těšovice - Tvrzice - Újezdec - Vacov - Vimperk - Vitějovice - Vlachovo Březí - Volary - Vrbice - Záblatí - Zábrdí - Zálezly - Zbytiny - Zdíkov - Žárovná - Želnava - Žernovice